Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM200BQ69YZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms