Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF43Q68DV7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF43Q68DV7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms