Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms