Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BROXQ5VW32 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BROXQ5VW32 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms