Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GARNL3Q5VVW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GARNL3Q5VVW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms