Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms