Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN11Q5T124 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms