Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF3Q5SZQ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF3Q5SZQ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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