Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms