Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAP1Q5SW96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms