Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTP2Q5QGT7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP2Q5QGT7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms