Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNT1Q5JUK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNT1Q5JUK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNT1Q5JUK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms