Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q56UQ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q56UQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q56UQ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q56UQ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q56UQ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q56UQ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q56UQ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q56UQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms