Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.6 ms