Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALFQ53S48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALFQ53S48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms