Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3BQ53EP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3BQ53EP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3BQ53EP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms