Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms