Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL40Q2TBA0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms