Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A9Q2M3M2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A9Q2M3M2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms