Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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