Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPP1Q16831 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms