Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLPPQ16740 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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