Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FOXD1Q16676 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FOXD1Q16676 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
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