Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGISQ16647 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGISQ16647 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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