Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DBN1Q16643 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBN1Q16643 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms