Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NREPQ16612 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NREPQ16612 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NREPQ16612 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms