Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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