Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA6Q15825 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA6Q15825 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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