Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NPTX1Q15818 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPTX1Q15818 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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