Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA2Q15560 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA2Q15560 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA2Q15560 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEA2Q15560 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEA2Q15560 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA2Q15560 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA2Q15560 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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