Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYR3Q15413 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RYR3Q15413 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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