Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PUM3Q15397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PUM3Q15397 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUM3Q15397 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUM3Q15397 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUM3Q15397 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PUM3Q15397 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUM3Q15397 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUM3Q15397 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUM3Q15397 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUM3Q15397 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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