Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELOBQ15370 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELOBQ15370 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms