Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KARSQ15046 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KARSQ15046 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KARSQ15046 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KARSQ15046 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KARSQ15046 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KARSQ15046 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KARSQ15046 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KARSQ15046 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KARSQ15046 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KARSQ15046 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KARSQ15046 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KARSQ15046 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KARSQ15046 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KARSQ15046 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KARSQ15046 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KARSQ15046 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KARSQ15046 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms