Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HDM1Q15032 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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