Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TBC1D13-204ENST00000475097 502 ntTSL 325.7■■□□□ 1.76e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRKD2-209ENST00000597589 1682 ntTSL 525.17■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.546e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.536e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SUGP2-205ENST00000594445 732 ntTSL 323.86■■□□□ 1.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS24-202ENST00000414932 1727 ntTSL 223.51■■□□□ 1.356e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.36e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CRIP2-210ENST00000551836 627 ntTSL 323.15■■□□□ 1.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ALYREF-203ENST00000511412 533 ntTSL 322.97■■□□□ 1.277e-16■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.216e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRKD2-212ENST00000599019 1703 ntTSL 522.03■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COPRS-205ENST00000579984 422 ntTSL 321.77■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EHMT1-246ENST00000637748 2006 ntTSL 521.77■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EPS15L1-213ENST00000599790 1921 ntTSL 521.49■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-202ENST00000325997 2235 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 221.38■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-208ENST00000529530 584 ntTSL 421.31■■□□□ 16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ATP13A1-209ENST00000487364 541 ntTSL 521.12■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COPRS-203ENST00000496655 1062 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-211ENST00000470731 2251 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP2K3-210ENST00000527123 535 ntTSL 420.62■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-202ENST00000524373 910 ntTSL 520.58■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-209ENST00000581705 1426 ntTSL 220.45■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt20.42■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A22-215ENST00000530360 736 ntTSL 520.37■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-206ENST00000602479 752 ntTSL 320.21■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-203ENST00000462569 762 ntTSL 220.14■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 420.14■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 420.14■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM183A-205ENST00000543891 924 ntTSL 320.13■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HMGXB4-203ENST00000420166 1257 ntTSL 220.06■□□□□ 0.87e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 219.57■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARRDC1-205ENST00000466367 866 ntTSL 1 (best)19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-211ENST00000593076 854 ntTSL 519.52■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKR7A2-204ENST00000489286 725 ntTSL 519.35■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-207ENST00000580875 704 ntTSL 219.32■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-217ENST00000533273 873 ntTSL 219.27■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARAP1-212ENST00000536885 639 ntTSL 219.27■□□□□ 0.687e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AMPD2-210ENST00000476688 1111 ntTSL 319.17■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRR12-202ENST00000593853 265 ntTSL 319.08■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NFKBID-203ENST00000585925 1036 ntTSL 319.03■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-205ENST00000466514 2199 ntTSL 218.86■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-213ENST00000482309 1994 ntTSL 218.85■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PIEZO1-207ENST00000475586 560 ntTSL 418.85■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TM6SF2-203ENST00000586107 528 ntTSL 318.8■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GCN1-207ENST00000550471 918 ntTSL 318.7■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 218.6■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-207ENST00000490091 1512 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RMDN3-208ENST00000560460 931 ntTSL 518.53■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EXT2-205ENST00000527014 580 ntTSL 418.51■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EXT2-209ENST00000532479 580 ntTSL 418.49■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 518.4■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PKN3-202ENST00000483521 597 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC25A22-217ENST00000531437 802 ntTSL 518.21■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TM6SF2-202ENST00000431465 1829 ntTSL 218.07■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 418.02■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 47.1
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