Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD6Q15008 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
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