Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7AQ13946 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PDE7AQ13946 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7AQ13946 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7AQ13946 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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