Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA4Q13772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA4Q13772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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