Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms