Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PWP1Q13610 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms