Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1orf61Q13536 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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