Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB3Q13509 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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