Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED1Q13445 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED1Q13445 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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