Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME3Q13232 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME3Q13232 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME3Q13232 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME3Q13232 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME3Q13232 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME3Q13232 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NME3Q13232 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME3Q13232 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME3Q13232 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME3Q13232 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME3Q13232 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME3Q13232 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME3Q13232 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME3Q13232 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NME3Q13232 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME3Q13232 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME3Q13232 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME3Q13232 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME3Q13232 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME3Q13232 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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