Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2BQ13224 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms