Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX3Q13185 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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