Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXF1Q12946 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXF1Q12946 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXF1Q12946 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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