Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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