Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX10Q12887 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX10Q12887 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX10Q12887 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX10Q12887 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX10Q12887 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COX10Q12887 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COX10Q12887 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COX10Q12887 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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