Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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